يستخدم دواء نيكسيوم في علاج حالات زيادة حموضة المعدة ويعالج مرض التهاب المريء التآكلي كما يتم تناوله لعلاج قرحة الإثني عشر، سواء كانت نشطة أو في مرحلة الشفاء، ولعلاج مرض الجزر المعدي المريئي بالإضافة إلى استخدامه في حالات الإمساك وعسر الهضم،
نيكسيوم في علاج حالات فرط إفراز المعدة مثل متلازمة زولنغر-أليسون، وكذلك لعلاج القرحة العصبية الناتجة عن التوتر.