يستخدم دواء اسيكلوفير في علاج مجموعة متنوعة من العدوى الفيروسية التي تسببها فيروسات الهربس وتشمل علاج عدوى الهربس البسيط التي تظهر على شكل قرح باردة أو تقرحات جلدية، معالجة الهربس التناسلي للمساعدة في تقليل الأعراض وتقليل انتشار الفيروس، الوقاية والعلاج من عدوى الجدري المائي لدى الأطفال والبالغين،
اسيكلوفير لعلاج القوباء المنطقية التي تحدث نتيجة تنشيط فيروس الهربس بعد الإصابة بالجدري، يستخدم كوقاية للأشخاص الذين يعانون من ضعف جهاز المناعة لتقليل خطر تكرار العدوى الفيروسية.